在硬盤上，一個簇是磁盤空間最小的劃分單位，也是操作系統能尋址訪問的最小單位，同時還是一個文件最小的占用空間。 在Windows XP下以NTFS文件系統格式化好的標準硬盤來說，簇的最大默認值是4KB(也就是4096字節)?，F在，每拷貝新文件 到硬盤上一次，或從硬盤上每刪除舊文件一次，以及每添加內容到已有文件中一次，都會因自己的每一次操作而不斷制造出 更多的磁盤碎片。舉個例子，當拷貝一個文件到硬盤上時，操作系統會把文件存放在硬盤上的第一個空閑簇中。 如果第一個 簇無法完全存放該文件的全部內容，操作系統會把文件分割成幾個部分，在填滿了第一個簇后，剩余的部分開始放進下一個 空閑簇里。 如果這第二個空閑簇不是恰好位于第一個之后，那么這個文件就被人為的分割成了幾個碎片。
在文件中添加信息時，碎片也往往一起產生。如果原文件因為添加內容而超過了原始簇的大小，操作系統將不得不把超出的 部分填入下一個空閑簇。 如果這個空閑簇湊巧又沒有位于原始簇之后，那么文件就又一次被分割為碎片了。此外，每一次從 硬盤中刪掉文件都會造成大量的簇重新可用，而這些原本就不連續的簇又大大的增加了新文件被碎片化的可能——除非被刪 除的文件事先已經被清理過文件碎片。時間愈久，忽視文件碎片帶來的問題就愈大。文件碎片的四處擴散，迫使硬盤的讀寫 更加頻繁。定位和讀取數據，讀寫移動的次數越多，讀取文件所花費的時間越久，硬盤性能因此受損愈大。有時情況會變得 更糟，文件碎片會導致整體性能的大幅滑坡，延長啟動時間，隨機產生的系統崩潰，以及不明原因的系統死機。實際上，碎片問題極端嚴重的一塊硬盤，甚至會出現系統根本無法正常啟動的情況。
磁盤碎片整理
目前最常見的磁盤碎片整理程序，是由Execuitive軟件公司授權，包含在Windows 2000和Windows XP系統中，設計用于整理 硬盤，將文件的內容碎片收集到一起，并將他們存放在硬盤起始位置的連續簇中。在這個過程中，磁盤碎片整理將所有的可 用簇朝磁盤尾部遷移。一旦磁盤碎片清理結束，所有的文件內容都將被存放在連續的簇里，存取文件時，讀寫移動的距離大 大減少，磁盤性能也就因此得到了提升。
盡管磁盤碎片整理的確可以提升性能，但是不得不手動的去執行它——必須每過一段時間就要想起來去運行一下才行。當然 ，很明顯的一個解決辦法就是使用日程計劃程序，安排磁盤清理程序自動運行。但是，磁盤碎片整理程序并非是被設計成自 動執行的。實際上，這個磁盤碎片整理程序是一個性能縮水的Diskeeper軟件，根據日程計劃自動執行的功能并未包含在該版 本里;如果想使用該功能，只能購買完全版的Diskeeper軟件，里面提供有智能日程安排技術，可以根據使用硬盤的習慣來制 定完全自動的磁盤整理計劃。
解決方案
在Windows Vista里，微軟公司最終添加了自動磁盤整理的功能。實際上，磁盤碎片整理程序可以被設置為每天清理硬盤一次
。當第一次安裝了5308版的Windows Vista，并不知道這個功能，聽到來自硬盤的噪音，就像以前習慣在Windows 3.X的時代 聽到的那種操作系統試圖努力將SWAP文件排成直線時、以及最初在Beta軟件中注銷時所發出的一樣。 當注意到他以規則的時 段持續產生后，打開任務管理器，發現磁盤碎片清理程序在后臺運行。沒有任何圖標或者接口指示告訴你這個程序正在運行 。但當我在開始菜單找到了它的圖標，并運行它之后。透過圖形界面，卻發現磁盤碎片清理程序的確已經在運行了。日程安 排出現在窗口中，如果點擊“調整安排”的按鈕，便可以根據自己的喜好來重新編排運行日程。
Vista的磁盤碎片清理程序
默認狀態下，磁盤碎片清理程序是被設定為自動清理硬盤。通過正確的設置磁盤清理程序的運行時間，可以很好的提升系統 性能，因為那意味著硬盤永遠不會因為出現太多碎片而明顯降低系統性能。看到這個功能，再加上其他性能增強程序比如 ReadyBoost、ReadyDrive、SuperFetch等，可以看出微軟公司確實試圖在為Windows Vista加入更多的優點，并試圖讓用戶獲 得最好的使用體驗，雖然增強性帶來了沉重的負擔，而操作系統對于能源的巨大需求也讓人不敢恭維。
